'cadd' ile etiketlenmiş blog gönderileri

Geleneksel ilaç keşif (Drug Discovery) süreci, milyonlarca kimyasal bileşiğin laboratuvar tezgahlarında tek tek (in vitro) test edildiği, yorucu, pahalı ve yüksek hata oranına sahip bir süreçtir. Ancak günümüzde Biyoinformatik ve Hesaplamalı Yapısal Biyoloji, bu süreci "Kuru Laboratuvarlara" (Dry Lab) taşımıştır. Bir hastalığa neden olan hedefin (Örn: Virüsün hücreye giriş reseptörü) üç boyutlu kristal yapısı biliniyorsa, bu reseptörü bloke edecek "Sihirli Mermiyi" (Ligand) bilgisayar ortamında tasarlayabiliriz.

Geleneksel ilaç keşif süreci, genellikle doğada bulunan veya kimya laboratuvarlarında sentezlenen milyonlarca farklı bileşiğin, hücre kültürlerinde tek tek test edilmesine dayanan yorucu bir "High-Throughput Screening" (Yüksek Verimli Tarama) işlemidir. Bu süreç ortalama 10 ila 15 yıl sürer ve bir molekülün raftan eczaneye ulaşması yaklaşık 2.5 milyar dolara mal olur. Başarı oranı ise %1'in altındadır. Modern bilim, bu verimsizliği aşmak için çözümü bilgisayar bilimlerinde, fiziğin temel yasalarında ve istatistikte bulmuştur: Bilgisayar Destekli İlaç Tasarımı (CADD) ve onun kalbi olan Moleküler Yanaştırma (Molecular Docking).